公元590年，距离韩擒虎、贺若弼攻破建康、灭亡陈朝才过去一年，江南的土地上却再度燃起烽火。原陈朝境内的世家豪族趁机举兵叛乱，大大小小的叛军势力遍布江南各州，他们攻陷州县、杀害隋朝委派的地方官员，刚刚完成统一的江南，眼看就要再度陷入分崩离析的乱局。隋文帝杨坚紧急下诏，任命杨素为行军总管，率领大军南下平叛，一场关乎新朝统一根基的清剿之战就此拉开序幕。
从京口渡江，首战踏平沿岸叛军据点
杨素接到平叛诏令后，第一时间调集水陆大军赶赴长江下游，从京口渡江进入江南腹地。当时叛军的核心势力盘踞在江浙一带，他们依托水网密布的地形，在沿岸的重要渡口和城池修筑工事，还打造了大量战船封锁水道，想把隋军阻挡在江南之外。
杨素没有选择步步推进的常规打法，他先派出一支精锐步骑从陆路突袭，快速扫清了长江南岸的零散叛军哨点，随后亲自率领主力水师顺着杨子津东下，在狼山附近的江面上和叛军的数百艘水师战船正面遭遇。隋军水师奋勇冲杀，一举击溃叛军的水上力量，彻底打通了南下的水上通道，让叛军依托长江构建的防线直接土崩瓦解。
水陆并进，追剿叛军主力不留死角
进入江南腹地后，杨素发现叛军利用当地熟悉的水网山林打游击，隋军大部队推进时他们就四散躲藏，大军刚离开就重新占领城池，平叛战事一度陷入拉锯。杨素立刻调整战术，把大军拆分成多支轻装精锐分队，水陆两路同步推进，不给叛军留下任何喘息的空间。
他亲自率领一支主力，从会稽一路直插叛军高智慧的大本营。高智慧在浙江东岸搭建起绵延百余里的营垒，还出动上千艘战船占据江面，摆出和隋军决一死战的架势。杨素采纳部将的建议，派出一支奇兵从侧翼的山间小路翻山越岭，绕到叛军的后方发起突袭，自己则亲率正面大军同步进攻，两面夹击之下，高智慧的主力瞬间溃败，带着残兵从海路向南逃窜。
为了彻底消灭叛军，杨素没有选择停驻在已收复的城池休整，反而亲自率领轻兵沿着海岸线一路紧追，连续追击中的叛军从浙江一直打到福建，沿途扫平了十几股盘踞在山林水寨中的叛军势力，最终在泉州彻底击溃高智慧的残部，将这个叛军核心势力彻底消灭。
以剿促抚，让江南真正重归安定
在清剿叛军的过程中，杨素并非一味依靠武力杀伐。对于那些被叛军胁迫参与作乱的普通百姓和地方小势力，他下令一概不予追究，还安排官吏安抚当地民众，恢复农业生产。而那些带头举兵叛乱、杀害地方官员的豪族首领，则全部被擒拿斩首，绝不姑息。
这场持续近一年的平叛战事，杨素先后扫平了江南地区数十支叛乱势力，彻底终结了自东晋以来江南世家大族拥兵自重、割据一方的传统。叛乱平定之后，隋朝在江南的统治才真正落到实处，南北之间的经济文化交流不再被地方割据势力阻断，刚刚完成统一的隋王朝，终于摆脱了随时可能再度分裂的隐患。
后世不少人评价杨素用兵“多权谋，知将略”，这场江南平叛之战最能体现他的军事特点：既敢率孤军深入千里追敌，又能根据江南的特殊地形灵活调整战术，最终以最小的代价，为新生的统一王朝彻底稳固了江南半壁江山。
